500.000 Britten vulden vragenlijsten in. Uw DNA wordt met die van hen vergeleken
De 500K-applicatie vergelijkt uw genotype met UK Biobank, een cohort van een half miljoen Britse deelnemers met gekoppelde gezondheidsgegevens. Wat die vergelijking oplevert, hoe groot de effecten werkelijk zijn, en wat een polygene score niet over u zegt.
Tussen 2006 en 2010 meldden ongeveer een half miljoen mensen uit het Verenigd Koninkrijk zich aan voor iets ongebruikelijks. Ze gaven bloed, lieten zich meten en wegen, en beantwoordden honderden vragen over hun gezondheid, werk, voeding en leefstijl. Daarna gaven ze toestemming om hun medische dossiers jarenlang te blijven volgen.
Dat is UK Biobank. Het genotype van vrijwel alle deelnemers is inmiddels bepaald, en de resource is beschreven in een centraal artikel (Bycroft et al., Nature, 2018, PMID: 30305743).
Het is een van de meest gebruikte datasets in de menselijke genetica. En het is de basis van de 500K-applicatie.
Hoe de vergelijking werkt
Voor elke vraag die aan die 500.000 mensen is gesteld, kan worden onderzocht welke genetische varianten samenhangen met welk antwoord. Uw eigen genotype wordt vervolgens tegen die uitkomsten gelegd: waar staat u ten opzichte van de verdeling in dat cohort?
De onderliggende rekenmethode volgt de aanpak van openbare, non-profit polygene-scoretools voor consumentengenetica (Folkersen et al., Frontiers in Genetics, 2020, PMID: 32714365).
Het resultaat is geen uitspraak over ziekte. Het is een positie op een verdeling.
Hoe groot zijn die effecten eigenlijk
Klein. Bijna altijd klein.
Voor de meeste complexe kenmerken verklaren polygene scores een bescheiden deel van de verschillen tussen mensen — vaak enkele procenten. Dat is genoeg om op populatieniveau echt te zijn, en te weinig om over één persoon een voorspelling te doen.
Er is bovendien een belangrijke beperking die zelden op de verpakking staat: UK Biobank-deelnemers zijn niet representatief. Ze zijn overwegend van Europese afkomst, gemiddeld ouder, welvarender en gezonder dan de Britse bevolking als geheel. Polygene scores die in zo'n groep zijn ontwikkeld, verliezen nauwkeurigheid wanneer ze op andere populaties worden toegepast.
Wie u bent, waar u woont en hoe u leeft blijven zwaarder wegen dan uw score.
Wat de applicatie wel en niet doet
De Health Traits-applicatie vergelijkt uw genotype met uitkomsten uit het UK Biobank-cohort en toont waar u op elke verdeling valt - dat wil zeggen: waar u terecht was gekomen als u aan het oorspronkelijke onderzoek had deelgenomen, en niet dat uw eigen risico verhoogd of verlaagd is.
Zij stelt geen diagnose en voorspelt geen ziekte. Een uitslag die geruststellend oogt is geen medische vrijwaring, en een uitslag die verontrustend oogt is geen aandoening. Wie zich zorgen maakt over de eigen gezondheid of familiegeschiedenis, bespreekt dat met een arts of klinisch genetisch consulent — niet met een applicatie.
Wat u krijgt is een vergelijking met een half miljoen Britten die de moeite namen om de vragen te beantwoorden. Dat is interessant. Het is geen diagnose.