Quelle sont les incidences génétiques sur votre santé?

Notre application 500K vous aide à mieux comprendre ces prédispositions génétiques liées à votre santé

 

L’application 500K provient d’une base de données de 500.000 personnes en Angleterre. Tous les membres de la base de données ont donné leur ADN et de nombreuses informations sur leur santé.

Elle vous permet d’examiner plus en détail certains de vos risques de santé grâce à votre ADN.

 

Comment cela fonctionne?

Votre ADN sera comparé aux 500 000 autres ADN de la base de données. Vous pourriez partager certains risques ou avantages liés à votre santé avec d’autres personnes de la base de données: votre ADN et certains ADN dans la base de données seront liés entre eux grâce à des variants d’ADN similaires.

 

Comment est ce que ce projet a commencé?

L’objectif initial de cette base de donnée est de créer une base de donnée suffisamment grande pour permettre aux scientifiques d’aller de l’avant avec la recherche.

“UK Biobank est une importante base de données nationale et internationale et un organisme public créé dans le but d’améliorer la prévention, le diagnostic et le traitement d’un large éventail de maladies graves et potentiellement mortelles, notamment le cancer, les maladies cardiaques, AVC, diabète, arthrite, ostéoporose, troubles oculaires, dépression et formes de démence. UK Biobank a recruté 500 000 personnes âgées de 40 à 69 ans en 2006-2010 dans tout le pays pour participer à ce projet. Ils ont pris des mesures, fourni des échantillons de sang, d’urine et de salive pour des analyses futures. Ils ont aussi fourni des informations détaillées sur eux-mêmes et ont accepté que leur santé soit suivie. Au fil des années, cela deviendra une ressource puissante pour aider les scientifiques à découvrir pourquoi certaines personnes développent des maladies particulières et d’autres pas. »

Lire plus (en anglais)

 

Les premiers résultats disponibles

Avec notre application, nous récupérons certains des résultats sur différents problèmes de santé potentiels. Bien sûr, veuillez noter que ces résultats ne sont que des indicateurs de risques potentiels pour la santé ou de prédispositions à la santé et qu’ils ne sont pas des rapports médicaux.

Notre objectif est de donner accès aux risques potentiels pour la santé des personnes afin qu’elles sachent le plus rapidement possible si elles doivent faire attention ou ajuster leurs activités, leurs habitudes nutritionnelles,… avant même qu’un problème de santé ne se pose.

Bien sûr, consultez votre médecin régulièrement pour obtenir des conseils médicaux.

 

Comment ces résultats sont-ils traités?

Pour chaque risque lié à la santé, nous vous donnons un résultat afin que vous sachiez si votre prédisposition est très supérieure à la moyenne, supérieure à la moyenne, moyenne, inférieure à la moyenne et très inférieure à la moyenne.

Vous aurez un tableau initial avec toutes les différentes prédispositions de santé triées selon leur classement par rapport aux moyennes.

Si vous voulez les vérifier, vous pouvez le faire en regardant les différentes catégories de santé.

 

Quelles sont les facteurs utilisés pour mesurer ces risques pour la santé?

Nous avons regroupé ces facteurs en différentes catégories: Diagnostics, Facteurs de vie, Antécédents familiaux, Santé et antécédents médicaux, Mode de vie et environnement, Médicaments, Opérations, Mesures physiques, Facteurs psychosociaux, Facteurs spécifiques au sexe, Sociodémographie, Environnement de travail.

 

Analyse de plus de 200 facteurs liés à la santé

Chaque catégorie comporte de nombreux éléments différents. Le but des catégories était de regrouper les facteurs présentant des caractéristiques communes.

Vérifions quelles sont ces différentes catégories:

    • Diagnostics: permettent de vérifier toute prédisposition potentielle aux risques pour la santé. Quelques exemples de diagnostics sont les suivants: anémie, angine de poitrine, ulcère, problèmes d’épaule, … la base de données contient plus de 140 diagnostics de santé.
    • Les premiers facteurs de la vie contiennent des données sur les questions liées aux expositions précoces: adoption, naissances multiples, tabagisme maternel à la naissance, allaitement maternel, faiblesse et taille de l’enfant.
    • Histoire de famille contient des données sur des questions liées à la taille de la famille, à l’ordre des frères et sœurs, aux antécédents médicaux familiaux (des parents et des frères et sœurs) et à l’âge des parents (âge du décès en cas de décès).
    • Santé et antécédents médicaux: contient des informations sur le passé et la santé actuelle, divisée par conditions médicales (y compris séries de questions relatives à certains symptômes spécifiques et / ou conditions), information sur le dépistage du cancer, médicaments et opérations … Plus de 250 champs …
    • Style de vie et environnement: contient des informations sur le mode de vie et les expositions personnelles, subdivisées en grands domaines … Comme consommation d’alcool, type de transport, activité physique, tabagisme ou non …
    • Médicaments: contient des données obtenues lors d’un entretien oral avec une infirmière qualifiée sur les médicaments et comprend des données sur le type et le nombre de médicaments pris.Si le participant indiquait sur l’écran tactile qu’il prenait l’une des classes de médicaments suivantes: réduction de la tension artérielle, diminution du cholestérol, traitement hormonal substitutif ou pilule contraceptive orale, l’enquêteur était invité à enregistrer le nom du médicament. Cette catégorie contient des données sur tous les traitements réguliers hebdomadaires, mensuels, etc. Elle n’inclut pas les médicaments à court terme
    • Opérations: contient des données sur le type d’opération (regroupées par région du corps et présentées dans une arborescence), le nombre d’opérations et la date de chacune.
    • Mesures physiques: contient des informations provenant de mesures physiques effectuées au centre d’évaluation et est divisé en sous-catégories en fonction du type de mesure physique effectuée.
    • Facteurs psychosociaux: contient des informations sur les facteurs psychosociaux, subdivisés en grands domaines … en tant que père ou mère vivant, irritabilité, décès d’un parent, prise de risque …
    • Facteurs spécifiques au sexe: contient des informations dans les sous-catégories hommes et femmes.
    • Sociodémographie: contient des informations sur les facteurs sociodémographiques, subdivisés en plusieurs domaines: diplôme universitaire ou au collége, retraité ou non, chômeur, transport pour travailler, …
    • Environnement de travail: contient le résultat du questionnaire en ligne sur le travail sain réalisé de juin à septembre 2015.

 

Consultez l’aperçu de l’application 500k.

 

Les six premiers mois de GenePlaza Start it @KBC

Start it @KBC, une superbe aventure… à recommander

 

Deux ou trois fois par an, Start it @KBC Startit fait un appel à des candidatures pour que les nouvelles startups puissent intégrer son programme accélérateur de startup. Ce programme permet aux startups de trouver un lieu pour croître mieux et plus rapidement. A priori, les startups rejoignent l’accélérateur pour une période de 1 à 1.5 an.

 

GenePlaza a fait partie de la première édition de Février 2018 :

GenePlaza a rejoint la communauté Start it @KBC!

Retrouvez ici, toutes les startups membre de Start It @KBC.

Qu’est ce que Start it @KBC ?

Startit s’est inspirée du modèle Californien Y Combinator qui est le plus gros accélérateur de startups aux Etats-Unis.

  • 6 centres en Belgique: Leuven, Bruxelles, Anvers, Courtrai, Gand et Hasselt.
  • 3 centres à l’international: Hongrie, New-York et bientôt à San Francisco.

Quel est le concept? Permettre aux startups d’accélérer leur croissance, de rencontrer des pairs, des parrains, des mentors et experts… A la différence de Y Combinator, et c’est peut-être lié à la météo belge 😉 KBC met à disposition des bureaux équipés aux startups.

La Kredietbank, ou KBC, une des plus grandes banques belge, a aussi toute une équipe de plus de 10 personnes totalement dédiées à ce beau projet. Merci la KBC.

Les partenaires du projet sont très nombreux: Accenture, Telenet, Imec et KBC évidemment… voici la liste complète des partenaires mais n’oublions pas non plus GAN Network, un réseau d’aide international aux startups dont Start It @KBC fait partie.

Enfin, beaucoup d’événements sont organisés.

Quels sont les objectifs de Start It @KBC?

  • Donner du support à des business atypiques
  • L’entrepreneuriat
  • Tous les marchés et tout les stades de développements
  • Pas de liens financiers
  • Connections avec le réseau
  • Gratuit avec soutien assidu 😉 .

Quelles sont les valeurs de Start It @KBC?

Empathie – Curiosité – Indépendance- Positivisme – Honêteté – Fun – Rapidité

 

 

Quelle est la procédure de sélection des startups?

  • Remplir le dossier concernant le projet / la société
  • Un pitch de 10 minutes projet auprès d’un commité de sélection si le dossier a été validé
  • Une réponse endéans les 24 heures
  • Un accès rapide à la structure après un “Bootcamp” de deux jours

Quand aura lieu le prochain round pour les nouveaux projets?

En Septembre 2018 commencera la procédure de sélection, date limite est le 18 Septembre, et les équipes sélectionnées feront effectivement partie du réseau dès Octobre.

Quel bilan après 6 mois pour GenePlaza?

Après 4 mois de présence au sein de Startit, nous avons eu l’honneur de présenter un update de la situation concernant GenePlaza. Ce board était composés de l’équipe de Startit ainsi que de différents experts externes.

Aujourd’hui nous sommes à six mois de cette belle expérience, quels sont nos enseignements?

  1. Une start up = une éternelle évolution… tel que dans le grand classique “The lean startup” d’Eric Ries… Build, Measure, Learn, Adjust…  Pivot or not?…
  2. Startit @KBC = Communauté locale: les autres membres de startups sont toujours ouverts et prêts à partager leurs expériences
  3. Une startup, une entreprise = ECOUTER LE CLIENT
  4. Les “Community managers” de KBC Startit locaux sont dédiés et passionnés par ce qu’ils font
  5. Nous avons posé notre candidature à Y Combinator, une superbe expérience. Le modèle anglosaxon reste un exemple pour de nombreuses start-ups et de nombreux scales ups. L’Europe est enfin de plus en plus active. Inscrivez vous au blog de Y Combinator
  6. Quand pivoter?

“Les Startups partagent leurs expériences au sein de la communauté Start it @KBC “

C’est un des “plus” incontestable de  Start it @KBC: la mise en commun de manière informelle d’expertise et la création d’échange entre les différentes startups.

Notre site à Bruxelles

Nous avons la chance d’avoir sur le site de Start it @KBC Brussels deux community manager: Anna et Laura. Elles connaissent tous les ins et outs de la communauté.

En plus de cela, les installations sont tops: Il y a tout ce dont vous pourriez rêver: plus de 800m2 de bureaux, de nombreuses salles de réunion, une machine à café 😉 , un terrain de mini-panel ;), un parking à vélo.

Venez nous visiter quand vous le voulez.

Quelle différence avec les espaces dédiés à la recherche et au coworking?

 

Nous avons aussi travaillé dans différents espaces de coworking, ceux-ci sont partagés par différentes sociétés.

Notre première impression, est qu’ici, avec les autres startups, même si les métiers sont différents, nous partageons beaucoup de sujets communs: Acquisition des clients, problématiques techniques, clouds, partages de resources…

L’agenda de cette fin du mois de Juillet 🙂

 

Notre Tuesday lunch

 

Avec vue sur le canal et Brussels Beach

Quel environnement pour les startups en Belgique? Les choses avancent…

Les mentalités sont fortement différentes que dans le monde anglosaxon mais cela change actuellement.

La fiscalité en Belgique a été ajustée par le gouvernement et donne droit à des déductions fiscales directement appliquées sur les montants d’impôts payés. Bref, nous parlons de déductions d’impôts de 30 à 45pc du montant investi.

 

Le financement reste compliqué pour les startups mais ce nouveau plan aide malgré tout. D’autres initiatives existent tel que le Crowdfunding et le Crowdlending avec par exemple la filiale de KBC: Boléro et enfin d’autres initiatives tel que les business angels existent aussi.

 

Quelques livres intéressants pour les startups

  • The Lean Startup, Eric Ries
  • Originals, Adam Grant
  • Traction, Gabriel Weinberg et Justin Mares
  • Hooked, Nir Eyal
  • Good to Great, Jim Collins
  • Wired to Create, Scott Barry Kaufman et Carolyn Gregoire
  • Value Proposition Design: How to Create Products and Services Customers Want de Alexander Osterwalder, Yves Pigneur, Gregory Bernarda, Alan Smith, Trish Papadakos
  • Zero to One, Peter Thiel
  • The $100 Startup, Chris Guillebeau

 

Stéphane

Qui sommes-nous et comment sommes-nous arrivés ici ? David Reich — de nouvelles découvertes grâce à l’ADN ancien

Photo by Jason Wong on Unsplash

 

Dans une étude fascinante, le généticien montre les effets des migrations et la nature métisse de l’Humanité grâce aux progrès du séquençage de l’ADN.

 

« Selon une étude d’ADN ancien, l’arrivée des peuplades du campaniforme a transformé la Grande Bretagne pour toujours » — voilà ce que titre le Guardian au mois de février, à propos de gens dont les ancêtres se trouvaient en Europe Centrale et plus à l’est dans les steppes. L’auteur de cette étude, le généticien de Harvard David Reich, nous livre enfin dans son ouvrage la première ébauche d’une histoire vraie des 5 000 dernières années.

La génétique a commencé à complémenter le travail effectué par les archéologues et les linguistes dans les années 1990, grâce à l’œuvre du mentor de Reich, le généticien italien Luca Cavalli-Sforza ; la génétique était alors le parent pauvre de ces disciplines car elle ne possédait que très peu de données. Mais cela a bien changé. Le génome est un palimpseste qui conserve de fortes traces du passé, de sorte que les populations actuelles peuvent révéler des choses ayant à voir avec les mouvements de celles qui les ont précédées. Ce qui a tout changé, c’est la possibilité, dès 2010, de séquencer l’ADN directement à partir des restes d’êtres humains anciens, parfois vieux de 40 000 ans.

Reich revisite les récentes avancées de la cartographie de l’histoire des premiers Humains, mais ses découvertes les plus spectaculaires concernent un passé plus récent. Les développements les plus importants de l’histoire humaine ont eu lieu au cours des 10 000 dernières années — après le retrait glaciaire — et pour l’Europe, les 5 000 dernières années sont essentielles. Bien que les études d’ADN ancien aient maintenant largement dépassé l’archéologie et la linguistique pour devenir la meilleure source de connaissance des populations humaines préhistoriques et de leurs migrations, elle s’articule avec ces deux disciplines au sein d’un processus où elles se renforcent les unes les autres.

Le travail de Reich peut enfin répondre à la question passionnante qu’avait d’abord posée un fonctionnaire britannique, Sir William Jones, qui a découvert en 1786 le lien de parenté entre le sanscrit et le grec ancien. Ce qui a conduit à la reconnaissance d’une vaste famille de langues indo-européennes qui comprend les langues germaniques, celtiques, italiques, certaines langues du Proche-Orient (l’iranien) et du nord de l’Inde (Hindi, Ourdou, Bengali, Punjabi, Marathi, etc.). Cependant, il n’existait pas à l’époque de consensus sur la façon dont tout cela avait pu se produire. Reich a démontré que les langues indo-européennes et la majeure partie de la composition génétique de l’Europe et du nord de l’Inde résultent de migrations datant d’il y a 5 000 ans, des migrations provenant des vastes steppes, ces plaines herbeuses qui bordent les mers Noire et Caspienne.

Sépulture campaniforme – Image du Musée de la Préhistoire des Gorges du Verdon

La plupart des personnes d’origine européenne entretiennent des liens génétiques et linguistiques étroits avec les peuples du Proche-Orient et ceux du nord de l’Inde. Ces gens étaient des pasteurs nomades qui conduisaient des véhicules à roues, montaient des chevaux domestiqués et commençaient à utiliser des produits laitiers — un ensemble de caractéristiques qui devait garantir leur domination partout où ils allaient. Leurs migrations ont été le moteur de l’âge de Bronze. Homère décrit une société où les chefs de guerre gagnaient en prestige et en richesses en perpétrant viols et pillages. Ce n’est pas très agréable à entendre, mais c’est très conforme à ce que nous savons aujourd’hui des porteurs de la culture de Yamna (les peuples du campaniforme représentaient la vague occidentale des migrations Yamna). A propos de leurs migrations à prédominance masculine, Reich commente : « les hommes des populations les plus puissantes ont tendance à se lier avec les femmes de populations moins puissantes ».

Il reconnaît, et c’est tout à son honneur, les abus commis à partir des histoires d’origines — notamment par l’idéologie nazie — et reconnaît que certains idéologues voudront exploiter — et contester — ses découvertes. Il est fascinant de savoir que la plupart des personnes d’ascendance européenne possèdent des liens étroits, génétiquement et linguistiquement, avec les peuples du Proche-Orient et du nord de l’Inde, mais qu’en est-il globalement et quelles sont les implications de ces nouvelles découvertes ?

La leçon essentielle à tirer de l’ADN ancien est que les populations d’un même endroit ont radicalement changé à plusieurs reprises depuis la grande expansion humaine post-glaciaire, et le fait de reconnaître la nature essentiellement hybride de l’Humanité devrait l’emporter sur toute notion de connexion mystique, de longue date, entre les peuples et l’endroit où ils se trouvent. Nous sommes tous, pour reprendre l’étiquette railleuse de Theresa May, « des citoyens de nulle part ». Les gens du campaniforme ont remplacé 90 % de la population de la Grande-Bretagne il y a environ 4 500 ans. Il faut ajouter à cela l’idée que toute vie, depuis ses débuts, a été un processus essentiellement improvisé et impur. Comme l’indique Reich : « les idéologies qui cherchent un retour à une pureté mystique volent en éclat face aux sciences dures ». Ses découvertes ont aussi d’importantes implications pour le domaine médical. Par exemple, ses recherches en Inde ont montré les conséquences profondes de la consanguinité des systèmes de castes. Il existe par exemple un très grand nombre de maladies récessives — dans certains couples les deux partenaires portent des gènes mutants inscrits depuis longtemps dans la lignée. Ces populations facilitent la chasse aux gènes parce que les gènes récessifs s’accompagnent de marqueurs caractéristiques.

L’image globale peinte par de Reich acquerra avec le temps beaucoup plus de détails — tout comme la grande étude de Darwin, qui n’était que le début de quelque chose, et non pas une fin. Nous devrions lui être reconnaissants, ainsi qu’à sa grande équipe de collaborateurs et à son épouse Eugenie Reich (écrivain scientifique qui a joué un grand rôle dans la création de son ouvrage) puisqu’ils nous transmettent aujourd’hui l’histoire essentielle. Leurs travaux sont captivants, tant par leur clarté que par leur portée.

Une révolution quant à notre façon de comprendre la dépression va transformer nos vies

L’article original a été publié dans The Guardian par Edward Bullmore, responsable du département de Psychiatrie de l’Université de Cambridge, et auteur de The Inflamed Mind (éditions Short Books). La dépression sévit dans de nombreuses familles, c’est bien connu. Mais ce n’est que très récemment, et après énormément de controverses et de frustrations, que l’on commence à savoir comment, et pourquoi. Les découvertes scientifiques majeures signalées la semaine dernière par le Psychiatric Genomics Consortium dans Nature Genetics représentent une avancée durement gagnée pour notre compréhension de ce trouble très commun et potentiellement invalidant.

Photo by Jose A.Thompson on Unsplash

Si vos parents ont souffert de dépression, vos chances d’en pâtir ou d’en avoir pâti augmentent considérablement. Le risque de faire une dépression est de un sur quatre pour l’ensemble de la population — chacun d’entre nous a donc 25 % de chances de vivre une dépression à un moment donné de sa vie. Et si vos parents étaient dépressifs, vos risques de l’être augmentent à un sur trois.

Cependant, la controverse a longtemps tourné autour du débat nature versus éducation. Le fils dépressif d’une mère dépressive est-il victime de l’éducation inadéquate et de l’environnement émotionnellement froid, et peu affectueux que cette dernière lui a procuré au cours de ses plus tendres années ? Ou bien est-il déprimé parce qu’il a hérité des gènes dépressifs de sa mère qui ont déterminé biologiquement son sort émotionnel, indépendamment des compétences parentales ? Est-ce la nature ou l’éducation, la génétique ou l’environnement qui expliquent la dépression au sein des familles ?

Au XXème siècle, les psychiatres sont ingénieusement arrivés à certaines des réponses à ces questions. On avait par exemple constaté que des vrais jumeaux — dont l’ADN est identique à 100 % — étaient plus susceptibles de vivre des expériences de dépression similaires que des faux jumeaux, qui ne partageaient que 50 % de leurs séquences ADN. Ce qui indiquait clairement que la dépression est génétiquement héritable. Mais au vingt-et-unième siècle, l’identité précise des « gènes de la dépression » n’est toujours pas claire. Depuis 2000, des efforts considérables de recherche ont été réalisés pour découvrir ces gènes, mais le champ a été brouillé par de fausses espérances et des résultats peu cohérents.

C’est pour cela que l’étude publiée la semaine dernière constitue un évènement marquant : pour la première fois, des scientifiques du monde entier — avec des contributions majeures de centres de recherche en génétique psychiatrique du Royaume Uni, largement financés par le Medical Research Council à l’Université de Cardiff, à celle d’Edimbourg et au King’s College de Londres — ont réussi à combiner des données d’ADN sur un échantillon suffisamment long pour localiser les régions du génome associées à un risque accru de dépression. On sait donc maintenant, et on peut en être presque certains, quelque chose d’important sur la dépression dont on n’avait pas idée l’année dernière à la même époque : sur les 20 000 gènes que comprend le génome humain, au moins 44 contribuent à la transmission du risque de dépression d’une génération à l’autre.

Oui mais voilà. Cela soulève pratiquement autant de problèmes que cela n‘en résout. Attardons-nous un peu pour commencer sur le fait qu’il existe de nombreux gènes à risque ; chacun d’entre eux contribue à une petite quantité de risques. En d’autres termes, il ne s’agit pas d’une preuve irréfutable, d’un gène solitaire qui fonctionnerait comme un interrupteur binaire, causant inévitablement la dépression chez les gens suffisamment infortunés pour en hériter. Soyons plus réalistes : nous héritons tous de certains de ces gènes impliqués dans la dépression et nos chances de déprimer dépendent en partie de la quantité de ces gènes et de leurs effets cumulés. A mesure que la recherche avance et que des échantillons toujours plus grands d’ADN sont disponibles pour des analyses, il est probable que le nombre de gènes associés à la dépression augmente encore.

Tout cela nous apprend donc que nous ne devrions pas poser de limites entre « nous » et « eux », entre les patients atteints de dépression et les gens bien portants : il est beaucoup plus probable que notre héritage génétique, fort complexe, nous situe sur un continuum de risques que nous partageons tous.

Quels sont ces gènes et que nous disent-ils des causes profondes de la dépression ? Il s’avère que nombre d’entre eux sont connus pour jouer un rôle important dans la biologie du système nerveux. Ce qui correspond à l’idée que les perturbations de l’esprit doivent refléter des perturbations sous-jacentes du cerveau.

Photo by Ben White on Unsplash

Et il y a plus surprenant encore : un grand nombre de gènes influant sur le risque de dépression jouent également un rôle dans le fonctionnement du système immunitaire. Il y a de plus en plus de preuves que l’inflammation, la réaction de défense de notre système immunitaire face à des menaces telles que l’infection, peut provoquer une dépression. On prend également de plus en plus conscience du fait que le stress social peut entraîner des inflammations accrues de l’organisme. On sait depuis des décennies que le stress social est un facteur à très haut risque pour la dépression. Et aujourd’hui, il semblerait que l’inflammation puisse être l’un des chaînons manquants : le stress provoque une réaction inflammatoire de l’organisme, qui entraîne des changements dans la façon de fonctionner du cerveau, lesquels provoquent à leur tour les symptômes mentaux de la dépression.

Connaître les gènes qui influent sur le risque de faire une dépression a aussi des implications importantes pour les traitements pratiques. Il n’y a eu aucune avancée de taille dans les traitements depuis les années 1990 environ, bien que la dépression soit la principale cause unique de handicap médical au monde. Nous devons trouver de nouvelles voies thérapeutiques et la nouvelle génétique est un excellent point de départ pour la recherche de traitements qui puissent réduire de façon plus précise les causes ou les mécanismes de la dépression. On pourrait aisément imaginer la conception, dans le futur, de nouveaux antidépresseurs qui pourraient cibler les protéines inflammatoires codées par les gènes influant sur les risques de dépression. Il est passionnant de penser que la nouvelle génétique de la dépression pourrait également déboucher sur des progrès thérapeutiques en psychiatrie.

Enfin, bien que je pense que ces découvertes de la génétique soient essentielles, je ne les vois pas comme devant mener à des divisions idéologiques. Elles ne prouvent pas que dans le cas de la dépression, « tout se passe dans le cerveau », ni que les traitements psychologiques sont inutiles. La génétique jouera biologiquement un rôle prépondérant mais si nous comprenons mieux le champ d’action de ces « gènes de la dépression », nous pouvons peut-être découvrir que nombre d’entre eux contrôlent la réponse du cerveau ou du corps face au stress lié à l’environnement dans lequel nous évoluons. Et dans ce cas, le meilleur traitement pour un patient pourrait être un médicament ciblant un gène ou une intervention ciblant un facteur environnemental comme le stress.

En bref, une compréhension plus approfondie de la génétique de la dépression nous mènera au-delà de la question de laquelle nous sommes partis : est-ce une question de nature ou d’éducation ? S’agit-il des gènes ou de notre environnement ? La réponse aura sûrement à voir avec les deux.

Sur la piste des gènes de l’intelligence

Merci à Stéphanie Benz pour son article très intéressant dans l’express.

Un millier de gènes liés à des différences de QI entre individus auraient été identifiés. Une découverte controversée.

 

Certains diront qu’il s’agit d’humour belge – et ils auront raison. Spécialisée dans les tests génétiques “récréatifs”, la start-up bruxelloise GenePlaza propose à ses clients de lire dans leur ADN l’origine de leurs ancêtres, leur vitesse d’endormissement, leur capacité à métaboliser le café et même… leur niveau d’intelligence ! En échange d’un peu de salive, “ils sauront comment leur quotient intellectuel se situe par rapport à celui des autres utilisateurs de ce service”, précise le site de la société. Sérieusement ? “Pas du tout, sourit Alain Coletta, son fondateur. Nous indiquons d’ailleurs bien que ces résultats ne disent rien de l’intelligence réelle des individus, et j’espère que personne ne les comprendra ainsi.” Dans ces conditions, pourquoi proposer un tel test ? “Pour le fun”, répond sans ambages le start-upper.

De nombreux gènes impliqués, avec chacun un effet faible

Pendant longtemps, les recherches dans ce domaine n’ont rien donné de concret. Pourtant, des analyses sur des jumeaux avaient montré que les gènes jouent un rôle dans les capacités cognitives, telles que mesurées par les tests de QI.

 

Retrouvez la suite de l’article dans son intégralité : Sur la piste des gènes de l’intelligence

Les premiers Britanniques modernes avaient la peau « sombre, voire noire », révélations des analyses d’ADN de l’Homme de Cheddar

Le génome de l’homme de Cheddar, qui a vécu il y a 10 000 ans, suggère qu’il avait les yeux bleus, la peau sombre et des cheveux noirs et bouclés.

Article originel par Hannah Devlin, correspondante scientifique du Guardian.

Une reconstruction médico-légale de la tête de l’Homme de Cheddar, réalisée à partir de nouvelles preuves scientifiques et de son squelette fossilisé. Photographie de Channel 4.

Les premiers Britanniques modernes, qui vécurent il y a environ 10 000 ans, avaient la peau « sombre, voire noire », selon une étude révolutionnaire d’ADN réalisée sur le plus vieux squelette entier de Grande-Bretagne que l’on ait retrouvé.

Le fossile, connu sous le nom de Cheddar Man, a été déterré il y a plus d’un siècle dans la grotte de Gough, dans le Somerset. On a beaucoup conjecturé quant aux origines et à l’apparence de l’Homme de Cheddar puisqu’il a vécu peu de temps après que les premiers colons aient traversé les terres pour passer de l’Europe continentale à la Grande Bretagne, à la fin de la dernière période glaciaire. Les personnes blanches d’origine britannique d’aujourd’hui descendent de ces populations.

On avait commencé par supposer que Cheddar Man avait la peau claire et les cheveux blonds, mais son ADN brosse un tout autre tableau, qui suggère fortement que ses yeux étaient bleus, son teint très sombre — voire noir — et ses cheveux noirs et bouclés.
La découverte montre que les gènes responsables d’une peau plus claire se sont répandus au sein des populations européennes bien plus tard que prévu — et que la couleur de la peau n’a pas toujours été un indicateur de l’origine géographique, contrairement à ce que l’on croit souvent aujourd’hui.

Tom Booth, un archéologue du Musée d’Histoire Naturelle qui a travaillé sur le projet, a déclaré la chose suivante : « Cela montre vraiment que ces catégories raciales imaginaires que nous avons sont vraiment des constructions très modernes, ou très récentes, que l’on ne peut absolument pas appliquer au passé ».

Yoan Diekmann, un biologiste computationnel de l’University College de Londres, qui fait également partie de l’équipe travaillant sur le projet est d’accord : le lien que l’on établit souvent entre le caractère britannique et la blancheur n’était « pas une vérité immuable. Cela a toujours évolué et évoluera toujours ».

Les découvertes ont été révélées avant un documentaire de Channel 4, qui a suivi le projet d’ADN ancien du Musée d’Histoire Naturelle de Londres et la création d’une nouvelle reconstruction médico-légale de la tête de Cheddar Man.

Pour effectuer l’analyse d’ADN, les scientifiques du musée ont percé un trou de deux millimètres de diamètre dans le vieux crâne pour en obtenir quelques milligrammes de poudre d’os. Et c’est de là qu’ils ont extrait le génome complet, qui contenait des indices sur l’apparence et le mode de vie de cet ancien parent.

Les résultats indiquent des origines du Moyen-Orient, suggérant que ces ancêtres auraient quitté l’Afrique, se seraient installés au Moyen-Orient puis dirigés vers l’Europe, avant de traverser le Doggerland, l’ancien pont terrestre qui reliait à l’époque la Grande-Bretagne à l’Europe continentale. Aujourd’hui, il est possible qu’environ 10 % de l’ascendance britannique blanche soit liée à cette population ancienne.

Cette analyse a par ailleurs exclu la possibilité d’un lien ancestral avec les individus qui vivaient dans la grotte de Gough il y a 5 000 ans, individus qui sembleraient avoir accompli des rituels cannibales terribles, comme ronger des orteils et des doigts humains — sans doute après les avoir fait bouillir — ou encore boire dans des tasses crâniennes polies.
La Grande Bretagne a été colonisée périodiquement, puis défrichée au cours des périodes glaciaires jusqu’à la dernière de ces périodes, il y a environ 11 700 ans. Depuis lors, elle a toujours été habitée.

Cependant, jusqu’à présent, on ne sait toujours pas si chaque vague de migrants venait de la même population en Europe continentale ; les derniers résultats suggèrent que cela n’était pas le cas.

L’équipe s’est penchée sur des gènes connus pour être liés à la couleur de la peau, des yeux, et à la couleur et à la texture des cheveux. En ce qui concerne le teint, il existe une poignée de variantes génétiques liées à une pigmentation moindre, dont certaines très répandues dans les populations européennes actuelles. Mais Cheddar Man était doté de versions « ancestrales » de tous ces gènes, ce qui suggère fortement qu’il pourrait avoir eu le teint « sombre, voire noir », mais avec des yeux bleus.

Les scientifiques pensent que la peau des populations ayant vécu en Europe s’est éclaircie avec le temps parce que les peaux claires absorbent plus la lumière du soleil, ce qui est nécessaire pour produire suffisamment de vitamine D. Les dernières trouvailles suggèrent que la peau claire serait apparue plus tard, probablement lorsque l’avènement de l’agriculture a signifié que les gens obtenaient moins de vitamine D malgré le fait que leur régime alimentaire contienne des poissons gras.

Le mode de vie de l’homme de Cheddar était sûrement celui d’un chasseur-cueilleur, qui élaborait des lames tranchantes à partir de silex pour dépecer des animaux, et qui utilisait des ramures de cervidés pour sculpter des harpons destinés à la pêche, ainsi que des arcs et des flèches.

Où vivaient vos ancêtres il y a 8.000 ans? Première mondiale

GenePlaza, le 30 Avril, 2018

Première mondiale chez GenePlaza

Où vivaient vos ancêtres il y a 8.000 ans?

L’application de GenePlaza “K14 Ancient Cultures Admixture” va vous donner la réponse!

Nous sommes très fier chez GenePlaza d’avoir la première application génétique mondiale qui reprend les génomes d’ancêtres du néolithique découverts récemment.

Il s’agit de découvertes fabuleuses, regroupées par Mr Khan au sein d’une même application et permettent d’avoir une compréhension unique de nos origines ancestrales jusqu’à 8.000 ans et ce en incorporant ces dernières découvertes.

Le calculateur ADMIXTURE parcoure votre génome et le compare aux cultures très anciennes d’Europe, d’Afrique et d’Asie Centrale et du Sud.

Mr Khan a dit a propos de sa dernière application K14:

“Ces nouveaux génomes récemment découverts ajoutent à notre compréhension de la démographie des populations d’Europe, d’Afrique et d’Asie. Donc nous pensons qu’il s’agit de l’application sur les origines ancestrale actuellement disponible la plus à jour existant à l’heure actuelle.

La différence principale avec l’application développée par Mr Khan “Ancient Admixture” est le fait que ce calculateur K14 divise les origines ancestrales en de plus anciens groupes néolithiques.


Comment recevoir cette étude avec votre propre génome?

  • Vous n’avez pas votre propre ADN

=> Achetez votre test kit ADN (pas de ventes aux Etats-Unis actuellement) sur GenePlaza et achetez l’application K14 ensuite pour 5€ une fois que vous avez reçu le décodage de votre ADN

  • Vous avez votre ADN

=> Enregistrez vous gratuitement sur GenePlaza et uploadez votre ADN puis vous pourrez acheter l’application de Mr Khan pour 5€, vous aurez ainsi directement le résultat de votre ADN accessible. 


Une revue rapide de l’application “K14 Ancient Cultures Admixture” 

 

Ces génomes de haute qualité ont apporté beaucoup à notre compréhension de la population démographique en Europe, en Asie et en Afrique. L’algorithme utilisé est détaillé sur le site du créateur; Eurasian DNA.

LE “K14 ANCIENT CULTURES” CALCULATEUR 

La motivation derrière ce calculateur provient de la publication d’une douzaine de génomes anciens de haute qualité voir “Mathieson et al., 2018”; “The Genomic History Of Southeastern Europe and in Olalde et al., 2017” et “The Beaker Phenomenon And The Genomic Transformation Of Northwest Europe”, et dans Narasimhan et al., 2018,” “The Genomic Formation of South and Central Asia.”

Pour augmenter la qualité des résultats et l’analyse des variants communs entre notre ADN et les différentes populations de références, seulement les génomes ayant les plus hauts taux de bivalence ont été choisis pour valider les fréquences allèles.

Ce calculateur reprend les génomes anciens disponibles dans les différentes études et permet de représenter les différentes cultures anciennes: Néolithique, Chalcolithiques, Âge de Bronze qui s’étendaient de l’Ouest de l’Europe jusqu’au centre de l’Asie et la Sibérie, et qui ont contribué à la création des gênes de base des différentes populations modernes résidant en Europe et en Asie.

Voici une carte des différentes cultures anciennes existant jusqu’il y a 8.000 ans

 

La population “Beaker”, dont la traduction littérale est “pot”, est connue pour ses potteries. La culture s’est répandue à travers l’Europe sans doute à partir de la péninsule ibérique jusqu’à la Pologne il y a environ 4700 ans et cette population a existé  jusqu’il y à 3800 ans. Cette population semble avoir remplacé la culture “Corded Ware” qui était établie avant leur arrivée dans l’Est de l’Europe.

Avant l’expansion de la culture “Beaker“, la Grande-Bretagne était occupée par les “fermiers Néolithiques” anglais (British Neolithic farmers) qui étaient très proches génétiquement des fermiers Néolithiques Ibériques, suggérant un mouvement vers la Grande-Bretagne depuis l’ouest de l’Europe plutôt que depuis l’Allemagne. Les fermiers Néolithiques du Sud Est de l’Europe et d’Allemagne sont plus que probablement des ancêtres aux fermiers Ibériques et anglais Néolithiques, ceux-ci étant éteint après l’arrivée des Chasseurs occidentaux (Western-European Hunter-Gatherers (WHG) ). Les WHG sont les occupants lors d’une longue période de l’Europe avant l’arrivée des fermiers Néolithiques (Neolithic farmers ) du proche Orient il y a environ 8.000 ans.

Les Western-European Hunter-Gatherers (WHG)  ont occupé l’Europe pour quelques millénaires depuis le Paléolithique supérieur et semblent avoir survécus sans mélange génétique jusqu’il y a 7800 ans en Serbie et en Roumanie sous la forme des “Iron Gates HG“. Par la suite, ils ont été absorbés par la culture des fermiers Néolithiques qui s’est répandue depuis l’Anatolie jusqu’en Europe, il y a environ 8.000 ans.

Le deuxième mouvement majeur de population en Europe est venu des Steppes Eurasiennes (Russie) vers l’Est au moment de l’âge de Bronze. Les populations des steppes Eurasiennes (Eurasien Steppe folks) sont elles-mêmes issues de cultures comme Yamna, Srubna et Andronovo et il est fort probable que c’est comme cela que les langues Indo-Européennes ont été introduites en Europe. Les européens actuels sont principalement issus de trois sources principales: WHG, “Neolithic farmers” du proche Orient, et des éleveurs des steppes Eurasiennes “Eurasian steppe pastoralists” , dans des proportions variées. Les gênes des éleveurs des steppes Eurasiennes, “Eurasian steppe pastoralists“, comprennent des gênes des chasseurs Européens, “European Hunter-Gatherers (EHG)”, des chasseurs du Caucase, “Caucasus Hunter-Gatherers (CHG)”, et des fermiers Iraniens du Néolithique “Iranian Neolithic farmer”.

Il y a aussi des contributions mineures au paysage génétique Européen provenant d’Afrique, du Sud-Ouest d’Asie, principalement dans le Sud de l’Europe et d’Asie de l’Est et de Sibérie qui sont plus que probablement arrivée par les populations liées à l’Age de Bronze et à la culture Karasuk à travers les Uralic, Scythians et les différents groupes Turcs.

Voici la liste des cultures anciennes dont nous parlons dans cette application

Ici, nous utilisons aussi pour la première fois, les génomes anciens de “Turan” (actuellement l’Iran, l’Afghanistan, l’uzbekistan, le Turkmenistan et  le Tajikistan), les “Indus Valley” (Pakistan actuel), et de nombreuses cultures dans le Kazakhstan et ses environs, qui sont supposées avoir introduit les langues Indo-Européennes dans la région. Les origines de la Steppe Eurasienne lient génétiquement l’Europe et l’Asie du Sud avec l’âge de Bronze. Les populations actuelles du Sud et de l’Ouest de l’Asie doivent leur existence à ces anciennes populations.

Résumé de l’article de Narasimhan et al. 2018 pre-print

Nos données révèlent un ensemble complexe de sources génétiques qui se sont combinées pour former les origines des populations d’Asie du Sud de ce jour. Nous documentons une évolution vers le Sud des origines ancestrales génétiques commencée à partir des Steppes Eurasiennes “Eurasian Steppe” et corrélées avec l’expansion connue des sites d’éleveurs depuis les Steppe de Turan au milieu de l’âge de Bronze (2300-1500 BCE). Ces populations des Steppes se sont mixées génétiquement avec les populations du “Bactria Margiana Archaeological Complex (BMAC)” qu’ils ont rencontré à Turan (à la base les premiers descendants des agriculteurs en Iran) par la suite.

Les populations des Steppes se sont intégrées plus au sud à travers le deuxième Millénaire avant JC, et nous voyons qu’elles se sont mélangées avec une population du Sud que nous documentons à différents sites avec des individus  particuliers montrant un mélange distinctif d’origines liées à des agriculteurs Iraniens “Iranian agriculturalists” et à des chasseurs d’Asie du Sud “South Asian hunter-gathers”. Nous appelons ce groupe “Indus Periphery ” car ces populations ont été trouvées en contact avec les cultures “Indus Valley Civilization (IVC)”,  à la frontière Nord de cette population, et aussi parce qu’ils sont génétiquement semblables aux groupes “post-IVC” dans la  “Swat Valley” du Pakistan.

En co-analysant les anciens codes génétiques et les données génomiques de diverses populations actuelles d’Asie du Sud, nous montrons que les populations liées à “Indus Periphery” sont la source génétique la plus importante en Asie du Sud – hypothèse cohérente avec l’idée que les populations “Indus Periphery” nous fournissent la première possibilité d’analyse des populations ancestrales de IVC – et nous développons actuellement un modèle pour la formation de groupes d’Asie du Sud proches au niveau temporel et au niveau géographique des sources “Indus Periphery“. Nos résultats montrent comment les origines ancestrales des Steppes sont liées génétiquement avec les populations  d’Europe et du Sud d’Asie dans l’Age de Bronze, et identifie des populations qui plus que probablement sont responsables pour répandre les langues Indo-Européennes à travers la plupart  de la région Eurasienne.

Voici une présentation des résultats de l’application K14 de GenePlaza et achetez la ici sur notre Appstore results on GenePlaza and Buy it after creating your account if you have your DNA or buy your DNA kit if you don’t have it yet.

 

Monsieur Khan est le scientifique qui a développé l’application K14. Voici son site internet: EurasianDNA.com

Quels sont les principes sur lesquels s’appuie l’application?

Cette application est dédiée à augmenter la compréhension des évolutions des différentes populations et cultures à travers les siècles. Pour faciliter cela, l’auteur, Monsieur Khan, emploie un arsenal d’outils, incluant les programmes tels que:

1- l’ “ADMIXTOOLS” du laboratoire Reich Lab: Qui permet d’analyser de manière formelle les génomes et le partages de gênes et de modéliser des exemples à partir de données ancestrales (qpDstat, qpAdm, f3, etc)
2- “PLINK”: Pour préparer et parcourir les données d’ADN
3- “BEAGLE”: Pour le phasage, l’imputation et l’analyse IBD
4- “ADMIXTURE”:  Pour le regroupement des individus en classes basé sur des fréquences d’allèles partagées pour certains allèles dérivés.

Vous souhaitez lire plus sur le sujet? 

Lisez l’article du Guardian en anglais:  “Arrival of Beaker folk changed Britain forever, ancient DNA study shows”

 

Quelques sites parlant de nous:

Deux sites partageant les données et comparant les différents résultats obtenus:

– Anthrogenica

– Theapricity

Références:
1. “The Genomic History of South-eastern Europe, Iain Mathieson et al., 2018.”
2. “The Beaker Phenomenon and the Genomic Transformation of Northwest Europe, Iñigo Olalde et al., 2017.”
3. “The Genomic Formation of South and Central Asia, Narasimhan et al., 2018.”

Les secrets de votre ADN sont à votre portée, L’Echo – 24 Février 2018 –

Les secrets de votre ADN sont à votre portée

Retrouvez l’article publié le 24 Févier dans l’Echo en suivant le lien.

“En 2007, Steve Jobs avait déboursé pas moins de 700.000 dollars pour faire analyser la séquence ADN de son cancer du pancréas. Aujourd’hui, si l’on veut en savoir plus sur notre prédisposition à certaines maladies ou l’origine de nos ancêtres, cela ne coûte que quelques centaines d’euros.”

Un petit peu de salive et beaucoup de patience

Concrètement, comment ça marche? Soit vous disposez déjà des données de votre ADN via une autre société comme 23andMe, Ancestry ou Gencove.Vous les téléchargez sur la plateforme de GenePlaza et vous avez accès à une série d’applications génétiques dont les prix varient entre 0,99 euro et 14,99 euros. Soit vous commandez un kit de prélèvement de salive (145 euros), vous le recevez dans les 3 à 10 jours par la poste et vous faites le test chez vous. Attention à bien lire le mode d’emploi: il est, par exemple, proscrit de boire, manger, chiquer ou fumer trente minutes avant le prélèvement.

Quelles applications?

Parmi ces applications génétiques, on en trouve sur les origines ethniques, la métabolisation du café, la perception des odeurs ou encore la prédisposition au neuroticisme.

Récemment, Gene Plaza a mis à la disposition de ses utilisateurs une nouvelle application, baptisée 500k, basée sur les résultats d’une étude de UK Biobank. Elle permet de dégager strong> certaines prédispositions sur la base de questions sur l’historique médical/santé de 500.000 personnes. “Ces 500.000 personnes ont répondu à une série de questions médicales, sociales, familiales. On y répond soit via un touchscreen, soit via une interview avec un expert. S’il y a des variants enrichis sur une question particulière, cela permet de faire avancer la compréhension. On essaie de comprendre, par exemple, pourquoi les personnes qui ont ces variants ont une voiture rouge”, explique Alain Coletta.
Retrouvez tout l’article ici:

Les secrets de votre ADN sont à votre portée

Merci à Sarah Godard pour son article dans L’Echo, journal quotidien économique belge.

Lancement de GenePlaza en Europe, la première plateforme génétique en ligne   

GenePlaza

Communiqué de presse

le 20 – Avril – 2018

 

www.geneplaza.com

Lancement de GenePlaza en Europe, la première plateforme génétique en ligne   

 

Actif depuis 2012 dans l’analyse des données génétiques, Alain Coletta et Robin Duqué lancent GenePlaza:

“La plateforme offre la possibilité aux particuliers d’accéder, à prix démocratique, aux informations relatives à leurs génomes et de découvrir l’incidence de l’ADN sur leurs modes de vie.”

 

  • Voulez- vous par exemple savoir si vous êtes plus performant le matin ou le soir?
  • Voulez-vous connaître la façon dont votre organisme réagit à certains aliments, votre tolérance au lactose ?
  • Voulez-vous apprendre comment votre palais apprécie le goût de certains aliments ?
  • Voulez-vous connaître vos origines?

 

Les réponses à ces questions se trouvent dans notre ADN. Grâce à la plateforme Gene Plaza, toute personne peut dorénavant obtenir et stocker ses données génétiques et les interpréter de manière à prendre des mesures pour améliorer son mode de vie.

 

Cette interprétation se fait grâce à des applications développées par des scientifiques du monde entier et accessibles via un smartphone ou un ordinateur.

 

GenePlaza est la première plateforme gérée par une société européenne offrant ce service en ligne à des particuliers .

A partir du mois d’Avril 2019, il sera étendu géographiquement vers les pays européens voisins (France, Royaume-Uni, Pays-Bas et Luxembourg) et visera à proposer une gamme plus étendue de plus de 100 applications génétiques.

 

Il existe aujourd’hui 8 millions d’individus disposant déjà de leurs données génétiques. On prévoit que cette population atteindra les 20 millions d’ici 2022. La plateforme GenePlaza vise à couvrir 15% de ce marché, soit 3 millions d’usagers qui auraient alors directement accès à leurs propres informations génétiques actualisées.

 

En pratique:

L’analyse de l’ADN se fait via la salive. Le particulier commande un kit de test ADN qui lui est envoyé à domicile. Il dépose dans un tube-test un échantillon de salive qu’il renvoie directement  au laboratoire de GenePlaza pour analyse. Une fois l’analyse terminée, la personne peut accéder à ses données génétiques sur la plateforme informatique de GenePlaza. Elle peut ensuite explorer son ADN grâce aux multiples applications disponibles en ligne qui lui permettent de mieux comprendre des aspects relatifs à sa santé, à sa nutrition, ses performances sportives, etc…

 

A propos de GenePlaza:   

En 2012, Alain Coletta, Francais d’origine et docteur en bioinformatique, lance une Spin-off d’universités Bruxelloise dans le but de développer InSilicoDB, une plateforme pour la gestion et l’analyse de données génétiques destinées aux chercheurs biologistes.

 

Avec GenePlaza, l’activité est étendue aux particuliers et offre ainsi aujourd’hui une nouvelle plateforme d’applications développées par des scientifiques pour le grand public et compte déjà plus de 10.000 utilisateurs.

 

Alain Coletta, docteur en bioinformatique et CEO dit : «GenePlaza est une percée dans le monde de la génétique. C’est la première fois que les particuliers peuvent avoir accès à leur ADN et acheter en ligne des applications spécifiques en fonction de leur intérêt. Ils peuvent également autoriser le partage de leur information génétique avec des chercheurs biologistes en vue d’améliorer la recherche scientifique et obtenir en échange les informations les plus pointues sur leurs gènes et leurs conséquences. »

 

Alain Coletta

Chief Executing Officer

+32(0)489 32 59 52

alain@geneplaza.com

 

GenePlaza, meilleure DNA marketplace et rating de 4.5 étoiles sur 5 par DNAtestingchoice

 

Nous sommes heureux de partager avec vous l’analyse que DNAtestingchoice a effectué sur GenePlaza.

Ils ont fait un travail détaillé sur notre produit et sur le site et notre appstore pour donner une analyse de la satisfaction des clients:

Nous sommes heureux de la note obtenue par notre site: 4.5 étoiles sur 5!

 

 

 

Retrouvez l’analyse en anglais sur le site de DNAtestingchoice